一种基于微流控的FFPE样本单细胞转录组测序方法

本发明提供了一种基于微流控的FFPE样本单细胞转录组测序方法，主要包括对FFPE单细胞核悬液进行前处理，以及后续的原位生化反应、上机捕获、二链合成和文库制备的过程。该方法对FFPE样本单细胞核悬液增加了低浓度甲醛短时固定这一处理步骤，具体是从FFPE样本解离出单细胞核悬液后，加入终浓度0.025%‑0.1%的甲醛固定3‑5分钟，再用甘氨酸终止反应。本发明实验发现，采用的低浓度甲醛对FFPE样本单细胞核悬液进行短暂固定可提高原位逆转录反应过程中引物对mRNA分子的捕获效率，从而只需要一次文库标签扩增，就可以富集出相同含量的文库，提高了文库构建效率，降低文库构建成本。