一种预测脑疾病中功能性非编码拷贝数变异致病性的方法

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一种预测脑疾病中功能性非编码拷贝数变异致病性的方法
申请号:CN202510942826
申请日期:2025-07-09
公开号:CN120977396A
公开日期:2025-11-18
类型:发明专利
摘要
本发明提供一种预测脑疾病中功能性非编码拷贝数变异致病性的方法,属于生物信息学技术领域。包括:收集脑相关特征构建脑相关特征集,脑相关特征集中元素的类型包括转录因子结合位点、组蛋白修饰及染色质可及性三种;构建融合二维卷积和swin‑transformer的混合模型,用于捕获DNA序列中脑相关顺式调控元件的协同调控特性并生成N维脑相关功能特征注释,利用脑相关特征集训练混合模型;构建两个脑相关拷贝数变异数据的CNV数据集,其中,混合数据集中数据类型包含编码与非编码,高置信度非编码数据集仅包含非编码数据;基于两个CNV数据集训练随机森林模型;混合模型和随机森林模型共同组成DefunCNV模型,预测脑疾病中功能性非编码拷贝数变异的致病性。
技术关键词
随机森林模型 拷贝数 矩阵 疾病 混合型 二维卷积神经网络 训练混合模型 DNA序列 蛋白质编码基因 调控元件 生物信息学技术 数据 转录因子 染色体 训练集 随机梯度下降 元素 编码结构