基于遗传频控池的冠豪猪算法在GWAS数据上检测SNP组合方法

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基于遗传频控池的冠豪猪算法在GWAS数据上检测SNP组合方法
申请号:CN202511036601
申请日期:2025-07-28
公开号:CN120544669B
公开日期:2025-09-26
类型:发明专利
摘要
基于遗传频控池的冠豪猪算法在GWAS数据上检测SNP组合方法,属于计算机数据处理与遗传学交叉技术领域,设计了四种不同的个体生成策略,分别为全局引导策略、协同扰动策略、局部探索策略和收敛加速策略;引入了带频率抑制机制的基因采样模块,即遗传频控池;引入了基于样本量自动推测最大可检测交互阶数的方法;采用K2评分与G检验相结合的显著性检测机制;通过本发明方法显著提升了计算效率和检测精度,有效识别与复杂疾病相关的高阶SNP组合。
技术关键词
组合方法 策略 算法 频率 样本 疾病 初始化方法 数据 采样模块 因子 机制 代表 位点 参数 度量 聚类 内存 索引 基因 规模