一种多算法挖掘病毒微小干扰RNA的方法及装置

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一种多算法挖掘病毒微小干扰RNA的方法及装置
申请号:CN202511108079
申请日期:2025-08-07
公开号:CN120977401A
公开日期:2025-11-18
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种多算法挖掘病毒微小干扰RNA的方法及装置,涉及生物学检测领域,方法包括:通过多种去接头算法对输入序列进行去接头,并对各所得序列进行合并与去重获得去接头序列;通过多种映射算法以级联模式将去接头序列映射至核糖体RNA数据库,输出第一未完全映射序列;采用同上映射方法将第一未完全映射序列映射至宿主基因组,输出第二未完全映射序列;通过多种映射算法将第二未完全映射序列映射至病毒基因组,第二未完全映射序列被任一映射算法以错配碱基数≤1的映射至病毒基因组时,则判定其来自病毒序列。本发明显著提升从海量转录组数据中挖掘病毒微小干扰RNA的效率和准确性。
技术关键词
映射算法 序列 病毒 RNA方法 种子 接头模块 位点 级联 频率 模式 索引 批量 存储计算机程序 映射方法 处理器 精度 存储装置 可读存储介质